Opérateurs régionaux souples, adaptatifs, les agences assurent plusieurs missions d'intérêt général, en proposant un espace de concertation et d'initiative aux acteurs locaux intervant dans les domaines de l'environnement, de l'énergie et du développement durable :

> La sensibilisation et l'information,
> L'éducation et la formation,
> La veille technique et juridique,
> L'élaboration de propositions de politiques régionales,
> L'accompagnement, l'animation territoriale, l'aide technique au montage de projets préparés par des collectivités locales ou des acteurs économiques et sociaux,
> L'expérimentation de méthodes et activités nouvelles,
> L'animation de réseaux de villes, de territoires, d'entreprises et de professionnels,
> La mise en oeuvre d'actions partenariales et contractualisées avec l'Union Européenne, l'Etat, l'ADEME, des Agences de l'Eau, EDF, GDF,
> L'animation d'observatoires régionaux de l'énergie et/ou de l'environnement.